建设工程招标代理服务费计费原则是：差额定率累进法。（上下浮动不超过20%）
主要的依据是三个文件：
1、《招标代理服务收费管理暂行办法》（计价格[2002]1980号）；本办法要全文学习（该文件最后是计算方法，有详细的例子）；
2、《国家发展改革委办公厅关于招标代理服务收费有关问题的通知》（发改办价格[2003]857号）本通知内容主要是将1980号文中的“谁委托谁付费”的原则进行了调整，调整为“招标代理服务费应由招标人支付，招标人、招标代理机构和投标人另有约定的，从其约定。”
3、《国家发展改革委关于降低部分建设项目收费标准规范收费行为等有关问题的通知》（发改价格[2011]534号）涉及招标代理服务费的条款为“四、降低中标金额在5亿元以上招标代理服务收费标准，并设置收费上限。货物、服务、工程招标代理服务收费差额费率：中标金额在5—10亿元的为0.035%；10—50亿元的为0.008%；50—100亿元为0.006%；100亿元以上为0.004%。货物、服务、工程一次招标（完成一次招标投标全流程）代理服务费最高限额分别为350万元、300万元和450万元，并按各标段中标金额比例计算各标段招标代理服务费。
中标金额在5亿元以下的招标代理服务收费基准价仍按原国家计委《招标代理服务收费管理暂行办法》（[2002]1980号，以下简称《办法》）附件规定执行。按《办法》附件规定计算的收费额为招标代理服务全过程的收费基准价格，但不含工程量清单、工程标底或工程招标控制价的编制费用。”
①招标代理机构从事招标代理业务，应当收取中标服务费，以支持企业经营。招标人一般没有必要收取中标服务费，因为是自己给自己采购、使用自己的资金。
②收取中标服务费必须在招标文件中明确，作为投标人的投标成本组成部分。如果未在招标文件中明确，投标人不会考虑这一部分费用。
③扣取投标保证金作为质保金的话，同样需要在招标文件中明确，否则中标人可以不答应。确实没有在招标文件中明确的，可以与中标人协商。
④招标文件中一般规定招标结束后，就将投标保证金退还给投标人。相关法律也是这样规定的。
招标代理服务费收费标准
